Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD1Q15116 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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