Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF6Q15052 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF6Q15052 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms