Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms