Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF235Q14590 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms