Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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