Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCINQ13939 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCINQ13939 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCINQ13939 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCINQ13939 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCINQ13939 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCINQ13939 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCINQ13939 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCINQ13939 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCINQ13939 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCINQ13939 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCINQ13939 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCINQ13939 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCINQ13939 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCINQ13939 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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CCINQ13939 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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CCINQ13939 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCINQ13939 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCINQ13939 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCINQ13939 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCINQ13939 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCINQ13939 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CCINQ13939 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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CCINQ13939 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCINQ13939 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCINQ13939 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCINQ13939 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCINQ13939 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCINQ13939 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCINQ13939 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCINQ13939 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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CCINQ13939 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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CCINQ13939 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCINQ13939 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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