Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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