Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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