Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SHROOM2Q13796 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHROOM2Q13796 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHROOM2Q13796 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
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