Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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