Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NAE1Q13564 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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