Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEUROD1Q13562 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
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