Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGDRQ13258 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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