Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
GRIN2BQ13224 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
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