Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1BQ13112 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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