Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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TRAF1Q13077 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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TRAF1Q13077 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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TRAF1Q13077 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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TRAF1Q13077 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF1Q13077 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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