Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CSTF3Q12996 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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