Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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NPRL3Q12980 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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NPRL3Q12980 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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NPRL3Q12980 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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NPRL3Q12980 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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