Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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