Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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GTF3C1Q12789 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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GTF3C1Q12789 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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GTF3C1Q12789 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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GTF3C1Q12789 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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GTF3C1Q12789 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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GTF3C1Q12789 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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GTF3C1Q12789 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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GTF3C1Q12789 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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GTF3C1Q12789 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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GTF3C1Q12789 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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