Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HMGXB3Q12766 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC34■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
HMGXB3Q12766 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
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