Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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