Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCBP1Q09161 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms