Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCK1Q08629 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms