Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms