Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms