Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms