Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms