Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms