Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREMQ03060 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREMQ03060 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREMQ03060 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CREMQ03060 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CREMQ03060 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CREMQ03060 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREMQ03060 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREMQ03060 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREMQ03060 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREMQ03060 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREMQ03060 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CREMQ03060 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREMQ03060 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CREMQ03060 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CREMQ03060 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CREMQ03060 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREMQ03060 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms