Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN2Q02246 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms