Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms