Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms