Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms