Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms