Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms