Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms