Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL7P80098 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL7P80098 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL7P80098 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL7P80098 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL7P80098 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL7P80098 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL7P80098 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL7P80098 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCL7P80098 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCL7P80098 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL7P80098 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL7P80098 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL7P80098 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL7P80098 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL7P80098 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL7P80098 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL7P80098 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL7P80098 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL7P80098 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL7P80098 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL7P80098 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL7P80098 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL7P80098 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms