Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2HP62256 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms