Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCS1P62166 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCS1P62166 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCS1P62166 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms