Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2FP61218 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2FP61218 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms