Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms