Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms