Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP4P57796 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP4P57796 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABP4P57796 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABP4P57796 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms