Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX10P56693 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX10P56693 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX10P56693 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX10P56693 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms