Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV3P56539 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV3P56539 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV3P56539 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV3P56539 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV3P56539 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV3P56539 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV3P56539 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV3P56539 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV3P56539 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms