Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAG2P55895 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAG2P55895 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms