Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP7P55210 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP7P55210 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP7P55210 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP7P55210 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP7P55210 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP7P55210 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP7P55210 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP7P55210 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP7P55210 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP7P55210 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP7P55210 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP7P55210 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP7P55210 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP7P55210 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP7P55210 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP7P55210 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP7P55210 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP7P55210 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP7P55210 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP7P55210 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms