Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NAPAP54920 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAPAP54920 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAPAP54920 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAPAP54920 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAPAP54920 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAPAP54920 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAPAP54920 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAPAP54920 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAPAP54920 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAPAP54920 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAPAP54920 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms