Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACLYP53396 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACLYP53396 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACLYP53396 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACLYP53396 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACLYP53396 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACLYP53396 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACLYP53396 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACLYP53396 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACLYP53396 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACLYP53396 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACLYP53396 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACLYP53396 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACLYP53396 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACLYP53396 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACLYP53396 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACLYP53396 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACLYP53396 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms